Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
P01669 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
P01669 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
P01669 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
P01669 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P01669 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
P01669 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
P01669 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01669 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P01669 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
P01669 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01669 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01669 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01669 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
P01669 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01669 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01669 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01669 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P01669 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01669 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01669 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01669 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P01669 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01669 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01669 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P01669 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P01669 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01669 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01669 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01669 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P01669 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
P01669 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P01669 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01669 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01669 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P01669 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
P01669 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01669 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P01669 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01669 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01669 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01669 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01669 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01669 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01669 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P01669 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01669 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01669 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01669 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01669 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
P01669 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
P01669 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01669 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01669 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01669 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P01669 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P01669 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01669 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01669 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P01669 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01669 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P01669 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P01669 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P01669 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01669 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01669 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P01669 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01669 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01669 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P01669 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01669 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
P01669 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01669 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P01669 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01669 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P01669 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
P01669 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01669 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01669 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
P01669 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
P01669 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P01669 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01669 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01669 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01669 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01669 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01669 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01669 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01669 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01669 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01669 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01669 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01669 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01669 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01669 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01669 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01669 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01669 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01669 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01669 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms