Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hcn2O88703 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hcn2O88703 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hcn2O88703 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hcn2O88703 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hcn2O88703 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hcn2O88703 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hcn2O88703 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hcn2O88703 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hcn2O88703 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hcn2O88703 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hcn2O88703 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hcn2O88703 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hcn2O88703 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms