Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng2O88602 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng2O88602 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng2O88602 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacng2O88602 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacng2O88602 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacng2O88602 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cacng2O88602 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cacng2O88602 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacng2O88602 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms