Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AvilO88398 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AvilO88398 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AvilO88398 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AvilO88398 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AvilO88398 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AvilO88398 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AvilO88398 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AvilO88398 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AvilO88398 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AvilO88398 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AvilO88398 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AvilO88398 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AvilO88398 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AvilO88398 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AvilO88398 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AvilO88398 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AvilO88398 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AvilO88398 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AvilO88398 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AvilO88398 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AvilO88398 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AvilO88398 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AvilO88398 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AvilO88398 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AvilO88398 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AvilO88398 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AvilO88398 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AvilO88398 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AvilO88398 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AvilO88398 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AvilO88398 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AvilO88398 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
AvilO88398 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AvilO88398 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AvilO88398 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AvilO88398 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AvilO88398 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AvilO88398 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AvilO88398 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AvilO88398 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AvilO88398 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AvilO88398 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AvilO88398 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AvilO88398 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AvilO88398 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AvilO88398 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AvilO88398 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AvilO88398 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AvilO88398 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AvilO88398 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AvilO88398 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AvilO88398 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AvilO88398 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AvilO88398 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AvilO88398 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AvilO88398 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AvilO88398 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AvilO88398 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AvilO88398 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AvilO88398 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AvilO88398 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AvilO88398 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AvilO88398 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AvilO88398 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AvilO88398 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AvilO88398 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AvilO88398 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AvilO88398 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AvilO88398 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AvilO88398 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AvilO88398 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AvilO88398 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AvilO88398 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AvilO88398 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AvilO88398 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AvilO88398 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AvilO88398 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AvilO88398 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AvilO88398 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AvilO88398 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AvilO88398 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AvilO88398 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AvilO88398 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AvilO88398 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AvilO88398 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AvilO88398 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AvilO88398 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AvilO88398 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AvilO88398 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AvilO88398 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AvilO88398 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AvilO88398 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AvilO88398 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AvilO88398 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AvilO88398 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AvilO88398 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AvilO88398 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AvilO88398 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AvilO88398 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms