Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rad51dO55230 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad51dO55230 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rad51dO55230 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad51dO55230 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad51dO55230 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad51dO55230 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad51dO55230 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad51dO55230 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad51dO55230 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms