Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BckdkO55028 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BckdkO55028 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BckdkO55028 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BckdkO55028 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BckdkO55028 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BckdkO55028 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BckdkO55028 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BckdkO55028 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BckdkO55028 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BckdkO55028 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BckdkO55028 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BckdkO55028 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BckdkO55028 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BckdkO55028 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BckdkO55028 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BckdkO55028 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BckdkO55028 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BckdkO55028 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms