Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgb3O54890 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itgb3O54890 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itgb3O54890 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itgb3O54890 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itgb3O54890 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Itgb3O54890 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itgb3O54890 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itgb3O54890 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itgb3O54890 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itgb3O54890 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Itgb3O54890 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itgb3O54890 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itgb3O54890 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Itgb3O54890 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Itgb3O54890 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms