Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tpd52l1O54818 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpd52l1O54818 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tpd52l1O54818 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpd52l1O54818 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tpd52l1O54818 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tpd52l1O54818 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tpd52l1O54818 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpd52l1O54818 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tpd52l1O54818 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tpd52l1O54818 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tpd52l1O54818 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tpd52l1O54818 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Tpd52l1O54818 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tpd52l1O54818 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tpd52l1O54818 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms