Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EdaO54693 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EdaO54693 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EdaO54693 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EdaO54693 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EdaO54693 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EdaO54693 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EdaO54693 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EdaO54693 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EdaO54693 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EdaO54693 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EdaO54693 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EdaO54693 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EdaO54693 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EdaO54693 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EdaO54693 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EdaO54693 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EdaO54693 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EdaO54693 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EdaO54693 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EdaO54693 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EdaO54693 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EdaO54693 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EdaO54693 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EdaO54693 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EdaO54693 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EdaO54693 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EdaO54693 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EdaO54693 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EdaO54693 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EdaO54693 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EdaO54693 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EdaO54693 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EdaO54693 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EdaO54693 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EdaO54693 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EdaO54693 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EdaO54693 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EdaO54693 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EdaO54693 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EdaO54693 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EdaO54693 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EdaO54693 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EdaO54693 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EdaO54693 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EdaO54693 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EdaO54693 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EdaO54693 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EdaO54693 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EdaO54693 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EdaO54693 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EdaO54693 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EdaO54693 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EdaO54693 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EdaO54693 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EdaO54693 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EdaO54693 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EdaO54693 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EdaO54693 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EdaO54693 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EdaO54693 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EdaO54693 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EdaO54693 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EdaO54693 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EdaO54693 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EdaO54693 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EdaO54693 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EdaO54693 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EdaO54693 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EdaO54693 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EdaO54693 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EdaO54693 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EdaO54693 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EdaO54693 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EdaO54693 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EdaO54693 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EdaO54693 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EdaO54693 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EdaO54693 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EdaO54693 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EdaO54693 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EdaO54693 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EdaO54693 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EdaO54693 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EdaO54693 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EdaO54693 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EdaO54693 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EdaO54693 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EdaO54693 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EdaO54693 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EdaO54693 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EdaO54693 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EdaO54693 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EdaO54693 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EdaO54693 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EdaO54693 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EdaO54693 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EdaO54693 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EdaO54693 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EdaO54693 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms