Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6aO35464 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6aO35464 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6aO35464 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6aO35464 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema6aO35464 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6aO35464 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6aO35464 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6aO35464 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema6aO35464 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema6aO35464 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema6aO35464 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema6aO35464 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema6aO35464 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sema6aO35464 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sema6aO35464 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sema6aO35464 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6aO35464 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms