Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clcn6O35454 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clcn6O35454 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clcn6O35454 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clcn6O35454 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clcn6O35454 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clcn6O35454 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clcn6O35454 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn6O35454 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Clcn6O35454 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Clcn6O35454 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Clcn6O35454 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clcn6O35454 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clcn6O35454 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clcn6O35454 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms