Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KeraO35367 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KeraO35367 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KeraO35367 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KeraO35367 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KeraO35367 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KeraO35367 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KeraO35367 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KeraO35367 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KeraO35367 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KeraO35367 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KeraO35367 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KeraO35367 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KeraO35367 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KeraO35367 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KeraO35367 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KeraO35367 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KeraO35367 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KeraO35367 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KeraO35367 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KeraO35367 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KeraO35367 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KeraO35367 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KeraO35367 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KeraO35367 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KeraO35367 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KeraO35367 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KeraO35367 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KeraO35367 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KeraO35367 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KeraO35367 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KeraO35367 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KeraO35367 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KeraO35367 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KeraO35367 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KeraO35367 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KeraO35367 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KeraO35367 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KeraO35367 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KeraO35367 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KeraO35367 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KeraO35367 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KeraO35367 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KeraO35367 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KeraO35367 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KeraO35367 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KeraO35367 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KeraO35367 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KeraO35367 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KeraO35367 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KeraO35367 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KeraO35367 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KeraO35367 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KeraO35367 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KeraO35367 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KeraO35367 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KeraO35367 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KeraO35367 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KeraO35367 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KeraO35367 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KeraO35367 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KeraO35367 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KeraO35367 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KeraO35367 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KeraO35367 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KeraO35367 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KeraO35367 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KeraO35367 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KeraO35367 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KeraO35367 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KeraO35367 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KeraO35367 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KeraO35367 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KeraO35367 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KeraO35367 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KeraO35367 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KeraO35367 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KeraO35367 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KeraO35367 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KeraO35367 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KeraO35367 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KeraO35367 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KeraO35367 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KeraO35367 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KeraO35367 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KeraO35367 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KeraO35367 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KeraO35367 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KeraO35367 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KeraO35367 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KeraO35367 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KeraO35367 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KeraO35367 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KeraO35367 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms