Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmb1O09061 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmb1O09061 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmb1O09061 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmb1O09061 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmb1O09061 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmb1O09061 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmb1O09061 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms