Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm3488M0QW81 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm3488M0QW81 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm3488M0QW81 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm3488M0QW81 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3488M0QW81 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3488M0QW81 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3488M0QW81 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3488M0QW81 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3488M0QW81 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3488M0QW81 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3488M0QW81 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3488M0QW81 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3488M0QW81 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm3488M0QW81 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm3488M0QW81 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm3488M0QW81 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3488M0QW81 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3488M0QW81 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3488M0QW81 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3488M0QW81 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3488M0QW81 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3488M0QW81 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms