Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm21798J3QNU5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm21798J3QNU5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21798J3QNU5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21798J3QNU5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21798J3QNU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms