Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1700014D04RikJ3QMS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700014D04RikJ3QMS2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700014D04RikJ3QMS2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700014D04RikJ3QMS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700014D04RikJ3QMS2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700014D04RikJ3QMS2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700014D04RikJ3QMS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms