Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp870J3QMA4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp870J3QMA4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp870J3QMA4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp870J3QMA4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp870J3QMA4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp870J3QMA4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp870J3QMA4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfp870J3QMA4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfp870J3QMA4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms