Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4930544D05RikJ3QK56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4930544D05RikJ3QK56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
4930544D05RikJ3QK56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
4930544D05RikJ3QK56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4930544D05RikJ3QK56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930544D05RikJ3QK56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930544D05RikJ3QK56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
4930544D05RikJ3QK56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
4930544D05RikJ3QK56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4930544D05RikJ3QK56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4930544D05RikJ3QK56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4930544D05RikJ3QK56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
4930544D05RikJ3QK56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms