Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp408H7BX78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp408H7BX78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp408H7BX78 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp408H7BX78 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp408H7BX78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp408H7BX78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp408H7BX78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp408H7BX78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp408H7BX78 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp408H7BX78 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zfp408H7BX78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp408H7BX78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp408H7BX78 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfp408H7BX78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp408H7BX78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp408H7BX78 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zfp408H7BX78 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp408H7BX78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms