Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn1r12G5E8G1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r12G5E8G1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r12G5E8G1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vmn1r12G5E8G1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r12G5E8G1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r12G5E8G1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r12G5E8G1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms