Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sclt1G5E861 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sclt1G5E861 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sclt1G5E861 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sclt1G5E861 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sclt1G5E861 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sclt1G5E861 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sclt1G5E861 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sclt1G5E861 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sclt1G5E861 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sclt1G5E861 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sclt1G5E861 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sclt1G5E861 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms