Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp2b1G5E829 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp2b1G5E829 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp2b1G5E829 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp2b1G5E829 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp2b1G5E829 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp2b1G5E829 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp2b1G5E829 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Atp2b1G5E829 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp2b1G5E829 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp2b1G5E829 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp2b1G5E829 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atp2b1G5E829 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atp2b1G5E829 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp2b1G5E829 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp2b1G5E829 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp2b1G5E829 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp2b1G5E829 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp2b1G5E829 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp2b1G5E829 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp2b1G5E829 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms