Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nccrp1G3X9C2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nccrp1G3X9C2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nccrp1G3X9C2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nccrp1G3X9C2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nccrp1G3X9C2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nccrp1G3X9C2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nccrp1G3X9C2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nccrp1G3X9C2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nccrp1G3X9C2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nccrp1G3X9C2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nccrp1G3X9C2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nccrp1G3X9C2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms