Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Chrna9G3X8Z7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chrna9G3X8Z7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Chrna9G3X8Z7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chrna9G3X8Z7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chrna9G3X8Z7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrna9G3X8Z7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna9G3X8Z7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna9G3X8Z7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrna9G3X8Z7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrna9G3X8Z7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms