Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim55G3X8Y1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim55G3X8Y1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim55G3X8Y1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim55G3X8Y1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim55G3X8Y1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim55G3X8Y1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim55G3X8Y1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim55G3X8Y1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim55G3X8Y1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms