Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmigd3G3X8R9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmigd3G3X8R9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmigd3G3X8R9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmigd3G3X8R9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmigd3G3X8R9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmigd3G3X8R9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmigd3G3X8R9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmigd3G3X8R9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmigd3G3X8R9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmigd3G3X8R9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmigd3G3X8R9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmigd3G3X8R9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmigd3G3X8R9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tmigd3G3X8R9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmigd3G3X8R9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmigd3G3X8R9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms