Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim15G3UY57 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim15G3UY57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim15G3UY57 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim15G3UY57 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim15G3UY57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim15G3UY57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim15G3UY57 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms