Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933402N22RikF7D1B3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933402N22RikF7D1B3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933402N22RikF7D1B3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933402N22RikF7D1B3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933402N22RikF7D1B3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4933402N22RikF7D1B3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933402N22RikF7D1B3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933402N22RikF7D1B3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4933402N22RikF7D1B3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
4933402N22RikF7D1B3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933402N22RikF7D1B3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933402N22RikF7D1B3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms