Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Igkv1-99F6XWB2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Igkv1-99F6XWB2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igkv1-99F6XWB2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Igkv1-99F6XWB2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Igkv1-99F6XWB2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igkv1-99F6XWB2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Igkv1-99F6XWB2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms