Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5861F6VCN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5861F6VCN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5861F6VCN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5861F6VCN9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5861F6VCN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5861F6VCN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5861F6VCN9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm5861F6VCN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm5861F6VCN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5861F6VCN9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5861F6VCN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm5861F6VCN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5861F6VCN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5861F6VCN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5861F6VCN9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5861F6VCN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5861F6VCN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms