Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prss56F2YMG0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prss56F2YMG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prss56F2YMG0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Prss56F2YMG0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss56F2YMG0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prss56F2YMG0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prss56F2YMG0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prss56F2YMG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prss56F2YMG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prss56F2YMG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prss56F2YMG0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss56F2YMG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prss56F2YMG0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prss56F2YMG0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss56F2YMG0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss56F2YMG0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms