Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Pik3c2bE9QAN8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pik3c2bE9QAN8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Pik3c2bE9QAN8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pik3c2bE9QAN8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pik3c2bE9QAN8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Pik3c2bE9QAN8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pik3c2bE9QAN8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pik3c2bE9QAN8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pik3c2bE9QAN8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Pik3c2bE9QAN8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pik3c2bE9QAN8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Pik3c2bE9QAN8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pik3c2bE9QAN8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pik3c2bE9QAN8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pik3c2bE9QAN8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Pik3c2bE9QAN8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Pik3c2bE9QAN8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pik3c2bE9QAN8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pik3c2bE9QAN8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pik3c2bE9QAN8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pik3c2bE9QAN8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pik3c2bE9QAN8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Pik3c2bE9QAN8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pik3c2bE9QAN8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pik3c2bE9QAN8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pik3c2bE9QAN8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Pik3c2bE9QAN8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pik3c2bE9QAN8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pik3c2bE9QAN8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pik3c2bE9QAN8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Pik3c2bE9QAN8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pik3c2bE9QAN8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pik3c2bE9QAN8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pik3c2bE9QAN8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pik3c2bE9QAN8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pik3c2bE9QAN8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pik3c2bE9QAN8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms