Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9G1

1700080E11Rik, RIKEN cDNA 1700080E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700080E11RikE9Q9G1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700080E11RikE9Q9G1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700080E11RikE9Q9G1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700080E11RikE9Q9G1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700080E11RikE9Q9G1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700080E11RikE9Q9G1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700080E11RikE9Q9G1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700080E11RikE9Q9G1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700080E11RikE9Q9G1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700080E11RikE9Q9G1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms