Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn1r238E9Q373 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r238E9Q373 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r238E9Q373 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r238E9Q373 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r238E9Q373 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r238E9Q373 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r238E9Q373 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vmn1r238E9Q373 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r238E9Q373 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r238E9Q373 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r238E9Q373 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r238E9Q373 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms