Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3250E9Q1M3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3250E9Q1M3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3250E9Q1M3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3250E9Q1M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3250E9Q1M3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3250E9Q1M3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm3250E9Q1M3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3250E9Q1M3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms