Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pdzd2E9Q1M1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pdzd2E9Q1M1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdzd2E9Q1M1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pdzd2E9Q1M1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pdzd2E9Q1M1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pdzd2E9Q1M1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdzd2E9Q1M1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pdzd2E9Q1M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pdzd2E9Q1M1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdzd2E9Q1M1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzd2E9Q1M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzd2E9Q1M1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzd2E9Q1M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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