Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r68E9Q0V3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r68E9Q0V3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r68E9Q0V3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r68E9Q0V3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r68E9Q0V3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r68E9Q0V3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms