Protein–RNA interactions for Protein: E9PV86

Mctp1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mctp1E9PV86 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mctp1E9PV86 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mctp1E9PV86 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mctp1E9PV86 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mctp1E9PV86 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mctp1E9PV86 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mctp1E9PV86 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mctp1E9PV86 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mctp1E9PV86 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mctp1E9PV86 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mctp1E9PV86 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms