Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm8994E9PV04 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Gm8994E9PV04 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm8994E9PV04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm8994E9PV04 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm8994E9PV04 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm8994E9PV04 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm8994E9PV04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm8994E9PV04 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm8994E9PV04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm8994E9PV04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms