Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm4491E0CX42 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4491E0CX42 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm4491E0CX42 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm4491E0CX42 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm4491E0CX42 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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