Protein–RNA interactions for Protein: D3Z642

4930595D18Rik, RIKEN cDNA 4930595D18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930595D18RikD3Z642 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930595D18RikD3Z642 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930595D18RikD3Z642 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930595D18RikD3Z642 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930595D18RikD3Z642 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930595D18RikD3Z642 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930595D18RikD3Z642 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930595D18RikD3Z642 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930595D18RikD3Z642 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms