Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kif28pD3YXS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kif28pD3YXS5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kif28pD3YXS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kif28pD3YXS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kif28pD3YXS5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif28pD3YXS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif28pD3YXS5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kif28pD3YXS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kif28pD3YXS5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms