Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc13D3YV10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc13D3YV10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc13D3YV10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc13D3YV10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc13D3YV10 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc13D3YV10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc13D3YV10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc13D3YV10 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc13D3YV10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc13D3YV10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc13D3YV10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc13D3YV10 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc13D3YV10 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc13D3YV10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc13D3YV10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc13D3YV10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc13D3YV10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc13D3YV10 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc13D3YV10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc13D3YV10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc13D3YV10 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc13D3YV10 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc13D3YV10 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms