Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrt4B2RU40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrt4B2RU40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrt4B2RU40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrt4B2RU40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prrt4B2RU40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prrt4B2RU40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrt4B2RU40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrt4B2RU40 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrt4B2RU40 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrt4B2RU40 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prrt4B2RU40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prrt4B2RU40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms