Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrn3B2RS91 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrn3B2RS91 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrn3B2RS91 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrn3B2RS91 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrn3B2RS91 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrn3B2RS91 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrn3B2RS91 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrn3B2RS91 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrn3B2RS91 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrn3B2RS91 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrn3B2RS91 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrn3B2RS91 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rrn3B2RS91 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrn3B2RS91 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrn3B2RS91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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