Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arhgap42B2RQE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Arhgap42B2RQE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Arhgap42B2RQE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Arhgap42B2RQE8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arhgap42B2RQE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arhgap42B2RQE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arhgap42B2RQE8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arhgap42B2RQE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap42B2RQE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arhgap42B2RQE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgap42B2RQE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Arhgap42B2RQE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgap42B2RQE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgap42B2RQE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap42B2RQE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Arhgap42B2RQE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arhgap42B2RQE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arhgap42B2RQE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arhgap42B2RQE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms