Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zbed5B2RPU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zbed5B2RPU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zbed5B2RPU8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zbed5B2RPU8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed5B2RPU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed5B2RPU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed5B2RPU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zbed5B2RPU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed5B2RPU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zbed5B2RPU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zbed5B2RPU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zbed5B2RPU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zbed5B2RPU8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zbed5B2RPU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms