Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Skint5A7XUY5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Skint5A7XUY5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Skint5A7XUY5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Skint5A7XUY5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Skint5A7XUY5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Skint5A7XUY5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Skint5A7XUY5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Skint5A7XUY5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Skint5A7XUY5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Skint5A7XUY5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Skint5A7XUY5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Skint5A7XUY5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Skint5A7XUY5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Skint5A7XUY5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Skint5A7XUY5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Skint5A7XUY5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Skint5A7XUY5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Skint5A7XUY5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Skint5A7XUY5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Skint5A7XUY5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Skint5A7XUY5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Skint5A7XUY5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Skint5A7XUY5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Skint5A7XUY5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Skint5A7XUY5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Skint5A7XUY5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Skint5A7XUY5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Skint5A7XUY5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Skint5A7XUY5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Skint5A7XUY5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Skint5A7XUY5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Skint5A7XUY5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Skint5A7XUY5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Skint5A7XUY5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Skint5A7XUY5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Skint5A7XUY5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Skint5A7XUY5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Skint5A7XUY5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Skint5A7XUY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Skint5A7XUY5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Skint5A7XUY5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Skint5A7XUY5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Skint5A7XUY5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Skint5A7XUY5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Skint5A7XUY5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Skint5A7XUY5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Skint5A7XUY5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Skint5A7XUY5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Skint5A7XUY5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Skint5A7XUY5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Skint5A7XUY5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms