Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms