Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-M5A7VMS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M5A7VMS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M5A7VMS3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M5A7VMS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M5A7VMS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M5A7VMS3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M5A7VMS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M5A7VMS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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