Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp8b5A3FIN4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atp8b5A3FIN4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atp8b5A3FIN4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp8b5A3FIN4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atp8b5A3FIN4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp8b5A3FIN4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp8b5A3FIN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp8b5A3FIN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atp8b5A3FIN4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atp8b5A3FIN4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp8b5A3FIN4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp8b5A3FIN4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp8b5A3FIN4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp8b5A3FIN4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp8b5A3FIN4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms